Exlevel フォーラムのこちらのスレッドで GrowFX MultiMap プラグイン＆サンプルオブジェクトが公開されています。
（GrowFXユーザーのみ利用可能）

このプラグインは、全く同じUVであっても別チャンネルのグラデーションの濃さに基づいて異なるマップを貼り付ける事を行います。
例えば以下のように、GrowFXで根元から先端に向かって頂点カラーマップでグラデーションを割り当てます。（この割り当ては非常に簡単）

GrowFX MultiMap で頂点カラーのグラデーションの濃さに基づいてメインのUVチャンネルにテクスチャーを割り当てれば、いちいち葉っぱ毎に異なるUV配置やUVチャンネル、マテリアルIDを作成する事なく異なるテクスチャーを割り当てる事ができます。

このプラグインはGrowFXオブジェクトに限らず、どのようなオブジェクトにでも適用できるので応用次第で便利に使えるプラグインです。